Aastal 2015, 15 aastat pärast üüratut katastroofi mille tagajärjel suri maailmas üle 2-3 miljardi inimese, alustavad vallutajad nimega "Angels" inimkonda ründama. Nüüd saavad ainult käputäis noorukeid juhtida oma omapärase meele tõttu hiiglaslikku orgaanilist mechat Evangelion, mis suudab sisstungijaid takistada. Seriaal jälgib EVA-01 noort pilooti Shinji Ikarit, kes vaenlaste vastu astuma peab.

Neon Genesis Evangelion on üks kuulsaimaid anime seriaale üldse, mida kiidetakse just atmosfääri, tegelaste ning mõtlemapanevate filosoofiliste küsimuste tõttu.